Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms