Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms