Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Atp8b5A3FIN4 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Atp8b5A3FIN4 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Atp8b5A3FIN4 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Atp8b5A3FIN4 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Atp8b5A3FIN4 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Atp8b5A3FIN4 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Atp8b5A3FIN4 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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