Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms