Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Samt1A2BED8 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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