Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms