Protein–RNA interactions for Protein: A2A3U9

Gm6268, Predicted gene 6268, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6268A2A3U9 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm6268A2A3U9 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm6268A2A3U9 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm6268A2A3U9 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm6268A2A3U9 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm6268A2A3U9 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm6268A2A3U9 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6268A2A3U9 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms