Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z205

Rfxank, DNA-binding protein RFXANK, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxankQ9Z205 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Gm43435-201ENSMUST00000199996 1438 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Gm25109-201ENSMUST00000122474 114 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms