Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cpne6Q9Z140 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cpne6Q9Z140 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cpne6Q9Z140 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cpne6Q9Z140 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cpne6Q9Z140 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cpne6Q9Z140 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cpne6Q9Z140 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms