Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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