Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Col4a4Q9QZR9 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Col4a4Q9QZR9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Col4a4Q9QZR9 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Col4a4Q9QZR9 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Col4a4Q9QZR9 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Col4a4Q9QZR9 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Col4a4Q9QZR9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Col4a4Q9QZR9 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Col4a4Q9QZR9 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Col4a4Q9QZR9 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Col4a4Q9QZR9 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Col4a4Q9QZR9 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Col4a4Q9QZR9 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Col4a4Q9QZR9 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Col4a4Q9QZR9 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Col4a4Q9QZR9 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Col4a4Q9QZR9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Col4a4Q9QZR9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Col4a4Q9QZR9 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Col4a4Q9QZR9 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
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Col4a4Q9QZR9 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Col4a4Q9QZR9 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Col4a4Q9QZR9 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
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Col4a4Q9QZR9 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Col4a4Q9QZR9 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Col4a4Q9QZR9 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Col4a4Q9QZR9 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Col4a4Q9QZR9 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Col4a4Q9QZR9 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms