Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms