Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
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Col5a3Q9JLI2 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Col5a3Q9JLI2 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Col5a3Q9JLI2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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