Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms