Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL70

Fanca, Fanconi anemia group A protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancaQ9JL70 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FancaQ9JL70 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FancaQ9JL70 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FancaQ9JL70 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FancaQ9JL70 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FancaQ9JL70 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FancaQ9JL70 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FancaQ9JL70 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FancaQ9JL70 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FancaQ9JL70 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FancaQ9JL70 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
FancaQ9JL70 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FancaQ9JL70 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FancaQ9JL70 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
FancaQ9JL70 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FancaQ9JL70 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
FancaQ9JL70 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
FancaQ9JL70 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FancaQ9JL70 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FancaQ9JL70 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
FancaQ9JL70 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
FancaQ9JL70 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FancaQ9JL70 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FancaQ9JL70 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FancaQ9JL70 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FancaQ9JL70 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FancaQ9JL70 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FancaQ9JL70 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FancaQ9JL70 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FancaQ9JL70 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FancaQ9JL70 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FancaQ9JL70 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms