Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Chrac1Q9JKP8 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Chrac1Q9JKP8 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Chrac1Q9JKP8 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Chrac1Q9JKP8 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Chrac1Q9JKP8 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Chrac1Q9JKP8 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Chrac1Q9JKP8 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Chrac1Q9JKP8 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Chrac1Q9JKP8 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Chrac1Q9JKP8 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Chrac1Q9JKP8 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Chrac1Q9JKP8 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Chrac1Q9JKP8 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Chrac1Q9JKP8 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Chrac1Q9JKP8 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Chrac1Q9JKP8 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms