Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms