Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
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Tuba8Q9JJZ2 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
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Tuba8Q9JJZ2 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Tuba8Q9JJZ2 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Tuba8Q9JJZ2 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Tuba8Q9JJZ2 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Tuba8Q9JJZ2 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Tuba8Q9JJZ2 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Tuba8Q9JJZ2 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tuba8Q9JJZ2 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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