Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
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Usp29Q9ES63 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Usp29Q9ES63 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Usp29Q9ES63 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Usp29Q9ES63 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Usp29Q9ES63 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Usp29Q9ES63 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Usp29Q9ES63 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Usp29Q9ES63 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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