Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

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Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ube3bQ9ES34 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ube3bQ9ES34 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ube3bQ9ES34 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ube3bQ9ES34 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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