Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Wdr61Q9ERF3 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Wdr61Q9ERF3 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Wdr61Q9ERF3 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Wdr61Q9ERF3 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Wdr61Q9ERF3 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Wdr61Q9ERF3 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Wdr61Q9ERF3 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Wdr61Q9ERF3 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Wdr61Q9ERF3 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Wdr61Q9ERF3 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Wdr61Q9ERF3 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Wdr61Q9ERF3 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Wdr61Q9ERF3 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Wdr61Q9ERF3 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Wdr61Q9ERF3 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Wdr61Q9ERF3 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Wdr61Q9ERF3 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Wdr61Q9ERF3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Wdr61Q9ERF3 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Wdr61Q9ERF3 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Wdr61Q9ERF3 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Wdr61Q9ERF3 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Wdr61Q9ERF3 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Wdr61Q9ERF3 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Wdr61Q9ERF3 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Wdr61Q9ERF3 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Wdr61Q9ERF3 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Wdr61Q9ERF3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Wdr61Q9ERF3 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Wdr61Q9ERF3 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Wdr61Q9ERF3 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Wdr61Q9ERF3 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Wdr61Q9ERF3 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Wdr61Q9ERF3 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Wdr61Q9ERF3 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Wdr61Q9ERF3 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Wdr61Q9ERF3 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Wdr61Q9ERF3 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Wdr61Q9ERF3 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Wdr61Q9ERF3 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Wdr61Q9ERF3 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Wdr61Q9ERF3 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Wdr61Q9ERF3 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Wdr61Q9ERF3 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Wdr61Q9ERF3 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Wdr61Q9ERF3 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Wdr61Q9ERF3 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Wdr61Q9ERF3 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Wdr61Q9ERF3 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Wdr61Q9ERF3 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Wdr61Q9ERF3 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Wdr61Q9ERF3 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Wdr61Q9ERF3 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Wdr61Q9ERF3 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Wdr61Q9ERF3 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Wdr61Q9ERF3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Wdr61Q9ERF3 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Wdr61Q9ERF3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Wdr61Q9ERF3 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Wdr61Q9ERF3 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Wdr61Q9ERF3 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Wdr61Q9ERF3 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms