Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tspan4Q9DCK3 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Tspan4Q9DCK3 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms