Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Rnf6Q9DBU5 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Rnf6Q9DBU5 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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