Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB91

Med29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med29Q9DB91 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med29Q9DB91 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms