Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms