Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Snx5Q9D8U8 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Snx5Q9D8U8 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Snx5Q9D8U8 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Snx5Q9D8U8 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Snx5Q9D8U8 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Snx5Q9D8U8 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Snx5Q9D8U8 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Snx5Q9D8U8 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Snx5Q9D8U8 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms