Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9D7E4 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9D7E4 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9D7E4 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9D7E4 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9D7E4 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9D7E4 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9D7E4 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9D7E4 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9D7E4 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9D7E4 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9D7E4 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9D7E4 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9D7E4 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9D7E4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D7E4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D7E4 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D7E4 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D7E4 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D7E4 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D7E4 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms