Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms