Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms