Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms