Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Atxn3Q9CVD2 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atxn3Q9CVD2 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Atxn3Q9CVD2 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Atxn3Q9CVD2 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atxn3Q9CVD2 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Atxn3Q9CVD2 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Atxn3Q9CVD2 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atxn3Q9CVD2 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atxn3Q9CVD2 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atxn3Q9CVD2 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atxn3Q9CVD2 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atxn3Q9CVD2 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Atxn3Q9CVD2 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Atxn3Q9CVD2 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Atxn3Q9CVD2 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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