Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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