Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rwdd1Q9CQK7 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rwdd1Q9CQK7 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rwdd1Q9CQK7 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rwdd1Q9CQK7 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rwdd1Q9CQK7 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rwdd1Q9CQK7 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rwdd1Q9CQK7 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rwdd1Q9CQK7 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rwdd1Q9CQK7 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rwdd1Q9CQK7 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rwdd1Q9CQK7 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rwdd1Q9CQK7 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rwdd1Q9CQK7 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rwdd1Q9CQK7 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rwdd1Q9CQK7 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms