Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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Atp6v0e1Q9CQD8 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
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Atp6v0e1Q9CQD8 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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Atp6v0e1Q9CQD8 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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Atp6v0e1Q9CQD8 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
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Atp6v0e1Q9CQD8 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
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Atp6v0e1Q9CQD8 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
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Atp6v0e1Q9CQD8 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
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Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
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