Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

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Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rpa3Q9CQ71 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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