Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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