Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms