Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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