Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms