Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms