Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hps4Q99KG7 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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