Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms