Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ddb2Q99J79 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms