Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

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Length 585 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Slc8b1Q925Q3 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Slc8b1Q925Q3 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Slc8b1Q925Q3 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Slc8b1Q925Q3 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Slc8b1Q925Q3 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Slc8b1Q925Q3 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms