Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
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Cldn16Q925N4 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
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Cldn16Q925N4 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
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Cldn16Q925N4 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
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Cldn16Q925N4 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
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Cldn16Q925N4 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
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