Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttc8Q8VD72 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttc8Q8VD72 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttc8Q8VD72 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttc8Q8VD72 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttc8Q8VD72 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttc8Q8VD72 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttc8Q8VD72 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttc8Q8VD72 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttc8Q8VD72 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc8Q8VD72 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc8Q8VD72 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc8Q8VD72 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms