Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3C1

Uncharacterized protein C2orf42 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8R3C1 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q8R3C1 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q8R3C1 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q8R3C1 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q8R3C1 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Q8R3C1 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Q8R3C1 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q8R3C1 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q8R3C1 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q8R3C1 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q8R3C1 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q8R3C1 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q8R3C1 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q8R3C1 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q8R3C1 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q8R3C1 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q8R3C1 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q8R3C1 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q8R3C1 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q8R3C1 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q8R3C1 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q8R3C1 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q8R3C1 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q8R3C1 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q8R3C1 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q8R3C1 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q8R3C1 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q8R3C1 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Q8R3C1 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q8R3C1 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q8R3C1 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q8R3C1 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q8R3C1 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q8R3C1 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q8R3C1 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q8R3C1 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Q8R3C1 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q8R3C1 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q8R3C1 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q8R3C1 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q8R3C1 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Q8R3C1 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q8R3C1 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q8R3C1 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q8R3C1 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q8R3C1 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Q8R3C1 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q8R3C1 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q8R3C1 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q8R3C1 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q8R3C1 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q8R3C1 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q8R3C1 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q8R3C1 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q8R3C1 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q8R3C1 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q8R3C1 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q8R3C1 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q8R3C1 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q8R3C1 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q8R3C1 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q8R3C1 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q8R3C1 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q8R3C1 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q8R3C1 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q8R3C1 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q8R3C1 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q8R3C1 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q8R3C1 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q8R3C1 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q8R3C1 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q8R3C1 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q8R3C1 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q8R3C1 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q8R3C1 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q8R3C1 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q8R3C1 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q8R3C1 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q8R3C1 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q8R3C1 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q8R3C1 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Q8R3C1 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q8R3C1 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q8R3C1 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q8R3C1 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q8R3C1 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q8R3C1 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q8R3C1 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q8R3C1 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Q8R3C1 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q8R3C1 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Q8R3C1 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q8R3C1 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q8R3C1 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q8R3C1 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q8R3C1 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q8R3C1 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q8R3C1 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q8R3C1 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q8R3C1 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms