Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Vmn1r200Q8R281 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
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Vmn1r200Q8R281 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Vmn1r200Q8R281 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Vmn1r200Q8R281 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
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Vmn1r200Q8R281 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Vmn1r200Q8R281 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Vmn1r200Q8R281 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vmn1r200Q8R281 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Vmn1r200Q8R281 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
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