Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Mterf1aQ8CHZ9 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms