Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm28Q8CGC6 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms